抗战胜利以来，党的组织得到很大的发展，到1947年党员已发展到270万名。经过严峻的革命战争的锻炼，党的队伍状况总的来说是好的，但在战争和土改激烈进行的条件下，在一些党组织特别是在一些农村基层党组织中，思想、作风和组织不纯的问题也明显暴露出来。根据中央指示，1947年7月在西柏坡召开的全国土地会议决定在各解放区结合土地改革开展整党运动。
结合土改进行的整党，以农村基层组织和党员干部为重点。主要方法是在党内展开批评与自我批评。主要内容是开展“三查”、“三整”。“三查”指查阶级、查思想、查作风，“三整”指整顿组织、整顿思想、整顿作风，进而克服党内存在的组织不纯、思想不纯、作风不纯现象。按照中央部署，各解放区纷纷召开各级干部会议，传达中央精神，组织大家批判党内存在的右倾思想，揭发组织不纯、作风不纯等严重现象。各地还派出工作团或工作组到农村基层蹲点，具体指导土改和整党工作。
随着工作的开展，中共中央及时总结并推广新鲜经验。例如，刘少奇将晋察冀解放区平山县的整党经验总结为：经过党的支部，邀集党外群众参加党的会议，共同审查党员和干部。1948年2月22日，中共中央发出由周恩来起草的《老区与半老区的土地改革与整党工作》的指示。该指示介绍了平山县的经验，要求除尚未巩固的新区（新解放区之简称）外，一切党的支部均应公开。公开党组织、开门整党的经验遂在全党推广开来。该指示还提出，不同地区应因地因时制宜，采取不同的工作方针。这使得搞“一刀切”的现象逐步得到扭转：老区的阶级关系比较清楚，整党侧重查思想、查作风，清洗变质分子；半老区尚有封建制度残余，阶级关系较模糊，整党侧重查阶级，解决党内组织不纯、作风不纯的问题；新区着重改进作风，待条件具备时再进行整党。同年5月25日，中共中央发出由毛泽东起草的《一九四八年的土地改革工作和整党工作》的指示，要求各中央局和分局从是年9月到明年3月，在各自辖区内按照正确政策，先实行初步整党，再完成党的支部组织的整理工作。这给整党划定了时间下限，兼顾了进度较慢的地区。
整党的具体流程大体如下：先在村支委会、后在全体党员中开展批评与自我批评，并邀集群众积极分子参会（这一过程同时也是党组织和党员公开化的过程）；征求一般群众特别是贫农团的意见，接受群众监督；召开支部大会，汇总各方意见，对党员进行评议并表决，根据表决结果决定谁是否留在党内；干部还须向全体村民通报工作、解剖思想；最后是改选支部，全体党员投票选出在群众中有威信的党员。在整党期间，酌情吸收贫农团中的积极分子入党。
通过整党，农村基层党组织在思想上、政治上和组织上有很大进步，党同群众的联系更加密切，为土地改革和解放战争的胜利提供了重要保证。
